members studies publications links

 

 

Last update 2014-09-30 17:50

新着情報 / What's new !

2014-09-11
生命医科学コースのB3が5人仮配属されました.

2014-07-07
菱木麻美さんがサンディエゴに留学されました

2014-07-01
新M1が1人配属されました.

2014-06-17
菊池壮太郎さんがダラスに留学されました.

2014-06-01
松村実験補助員が着任されました.

2013-08-07
新M1が5人配属されました.

2013-05-01
大井特任助手が着任されました.

2013-04-01
有田准教授が着任されました.

2013-04-01
橋本准教授が、静岡県立大学薬学部に教授として赴任されました.

2012-09-01
根谷崎特任助手が着任されました.

2012-06-27
新M1が5人配属されました

以前の記事はこちら 


 

研究内容の紹介( Japanese )
佐藤 衛 教授
禾 晃和 准教授
有田 恭平 准教授

業績一覧 / Publications

有益サイト BioKids Wiki (By Dobuo)

分子置換法によるTRF2-DNA複合体の結晶構造解析(CCP4I & COOT)

Sasaki-table

COOTの使い方(PDF)

COOTを使った学生実習(PDF)
(COOTマニュアル)

バイオエキスパート11の資料
(原子の解像度でわかるタンパク質の構造と機能)

Tips

リガンドの作り方

       

研究室の概要 / Structural Biology Laboratory

当研究室は、生体内で起こる重要なイベントに関与するタンパク質群を対象に、それら蛋白質の立体構造で決定し、生体高分子間の多元的な相互作用に基づく機能発現機構を物理化学的な手法によって解析し、分子認識や制御機構といった細胞で起こる基本的なプロセスを構造生物学的な見地から明らかにすることを目的にしている。対象としているタンパク質は、主にヒト、植物、酵母由来のタンパク質で、シグナルの受容と伝達に関与するタンパク質やDNAの転写・複製・修復・組換に関与するタンパク質であり、それらは疾患に関与している物も少なくない。主な研究手法はX線や中性子線を用いた結晶構造解析法および溶液散乱法であり、これらの手法を相補的に用いる。結晶構造解析法で得られる原子レベルの詳細な高次構造や分子間の多元的相互作用とともに、溶液散乱法を用いてリガンド結合に伴う高次構造変化の動的解析や非天然状態の動的挙動を解析する。疾患関連タンパク質については、抗体医薬等の薬剤開発を目指した研究を進めている。

右の図は、当研究室で最近決定された、ヒト由来ペプチジルアルギニンデイミナーゼ4(PAD4)のX線結晶構造である。この研究成果はNature Structure and Molecular Biology誌に掲載された。PAD4は関節リウマチに関与するタンパク質のであり、得られた立体構造を基に、関節リウマチの治療を目指した阻害剤開発を進めている。

X-ray or neutron diffraction (scattering) analysis of biologically important systems such as DNA transcription / recombination / repair / replication / translation and intracellular signal transduction is of particular importance to elucidate the structure-function relationship of the biological systems in living cells. Our ultimate goal is to understand the protein-protein, protein-nucleic acid or protein-lipid interactions from the high resolution crystal structure analysis and the time-resolved solution scattering analysis, and to establish general principles for architectures of biological supramolecular complexes to describe the physical chemistry of these cellular functions.

PAD4のX線結晶構造 (2004)

< 各研究室へのリンク  生命医科学研究科  横浜市立大学 >

研究室内ページ / Local access only

更新履歴

このページに関するお問い合わせは
xtaltsurumi.yokohama-cu.ac.jp