生命医科学研究科 村上優貴さんが、第52回構造活性相関シンポジウムにてSAR Presentation Awardを受賞！

生命医科学研究科の村上優貴さんが、2024年12月12日（木）・13日（金）に川崎市産業振興会で開催された第52回構造活性相関シンポジウムにおいて、SAR Presentation Awardを受賞しました。おめでとうございます。
村上さんの発表についてご紹介します。

受賞者
生命医科学研究科 博士後期課程１年
生命情報科学研究室所属
村上   優貴むらかみ 　ゆうき　さん

指導教員慧
大学院生命医科学研究科/理学部
生命情報科学研究室 寺山慧 准教授

受賞内容

第52回構造活性相関シンポジウム
SAR Presentation Award（ポスター発表）受賞

発表タイトル
「細胞膜透過性を考慮したPROTACリンカー生成AIの開発」

今回は、細胞膜透過性を考慮したPROTAC (proteolysis targeting chimera) リンカー生成AIに関する内容を発表しました。タンパク質分解誘導剤であるPROTACは、次世代型医薬品として注目されています。しかし、2つのリガンドとそれらを繋ぐリンカーで構成されるPROTACの分子量は、一般的な低分子医薬品と比べて大きくなってしまい、細胞膜透過性が低い傾向にあります。細胞膜透過性を含むPROTACの物理化学的特性は、リンカーの違いにより変化することが知られており、リガンドの組み合わせごとにリンカーを最適化する必要があります。そこで本研究では、当研究室で開発している分子構造生成AI ChemTSv2*1を拡張し細胞膜透過性向上を目指したPROTACのリンカー設計手法を開発しました (図1)。本手法を用いてPROTACのリンカー設計を試みたところ、細胞膜透過性の予測値が高いPROTACのリンカー設計に成功しました。本研究は、より優れた薬物動態を有するPROTAC開発への応用が期待されます。

（用語説明）
*1ChemTSv2：生命情報科学研究室で開発している分子生成AIで、薬から材料まで様々な機能性分子を設計可能

 

この度は名誉ある賞を頂き、大変光栄に思います。今回のシンポジウムでは、多くの方々から様々な角度でご意見をいただき、新たな視点や気づきを得ることができました。本研究の遂行や発表準備にあたりご指導いただきました、寺山先生をはじめとした生命情報科学研究室の皆様、共同研究者にこの場を借りて御礼申し上げます。今回の受賞を励みに、さらなる研究の発展に向けて精進してまいります。

村上さん、SAR Presentation Awardの受賞おめでとうございます！
この研究は、村上さんが本研究室に配属された当初から自身で構想していたテーマであり、近年非常に注目を集めている新しい創薬モダリティであるPROTACに関するものです。膜透過性については公共データが非常に限られているなど多くの困難がありますが、村上さんの研究がこのような形で評価されたことを、大変嬉しく思います。今後、この研究をさらに発展させてくれるものと大いに期待しています。
また、この研究は、国立医薬品食品衛生研究所 有機化学部の出水先生との共同研究です。いつも大変お世話になっておりますが、この場を借りて改めて感謝申し上げます。